Anmerkung: Das Programm BibTeX wird in den Hilfedateien häufig erwähnt. BibTeX ist ein Hilfsprogramm zur Erstellung bibliographischer Angaben in LaTeX-Dokumenten, das Oren Patashnik entwickelt hat. Dasselbe Dateiformat wird von CiteMaker benutzt, einem Hilfsprogramm zur Erstellung von Bibliographien mit Adobe FrameMaker.
JabRef ist ein Programm zur Verwaltung von BibTeX-Dateien. Es benutzt kein eigenes Dateiformat, d.h. dass Sie Ihre Dateien direkt im BibTeX-Format (Dateiendung .bib) laden und speichern. Sie können aber auch bibliographische Datenbanken in anderen Formaten in JabRef importieren.
JabRef unterstützt Sortier- und Suchfunktionen, um einen Überblick über den Inhalt Ihrer Datei zu bekommen. Sie können der Datei ganz einfach neue Einträge hinzufügen, ohne sich daran erinnern zu müssen, welche Informationen benötigt werden. Außerdem kann JabRef BibTeX keys automatisch generieren. JabRef ist sehr nützlich, wenn Sie BibTeX oder CiteMaker benutzen, kann aber auch für diejenigen sinnvoll sein, die andere Bibliographie-Systeme benutzen oder schlicht und einfach ihre Literaturquellen organisieren wollen.