Note : Le programme BibTeX est mentionné de nombreuses fois dans ces fichiers d'aide. BibTeX est un utilitaire pour la génération de références bibliographiques dans les documents LaTeX, créé par Oren Patashnik. Le même format de base de données est aussi utilisé par CiteMaker, un utilitaire pour la génération de bibliographie d'Adobe FrameMaker.
JabRef est un programme permettant l'exploitation des bases de données BibTeX. Ce programme n'utilise aucun format de fichier interne, ce qui signifie qu'habituellement vous ouvrez et sauvez vos bases de données directement dans le format .bib de BibTeX. Cependant, vous pouvez aussi importer dans JabRef d'autres formats de bases de données bibliographiques.
JabRef possède des fonctionnalités de tri et de recherche afin de vous donner une vue d'ensemble du contenu de vos bases de données. Vous pouvez facilement ajouter de nouvelles entrées à vos bases de données sans avoir à vous souvenir des informations requises, et les clefs BibTeX peuvent être générées automatiquement. JabRef sera surtout utile aux utilisateurs de BibTeX ou CiteMaker, mais il peut aussi être utile à ceux qui se servent d'autres systèmes de référencements ou qui veulent simplement organiser leurs sources bibliographiques.